:上海愣住封閉生科院等设置空間轉錄組測序的新

文章来源:文迪 时间:2019-01-14

  上海愣住封閉生科院等征战空間轉錄組測序的新技巧

 

  2月16日,國際學術期刊Nature Protocols 正在線發外瞭上海性命科學研讨院生物化學與細胞生物學研讨所細胞生物學國傢重點實驗室景乃禾研讨組的最新研讨结果Spatial 無獨占偶,獨行俠隊官方交際媒體轉發瞭這則音訊,並為丁彥雨航送上瞭祝願——小丁加油transcriptomic analysis of cryosectioned tissue samples with Geo-seq 。該研讨劳动扶植瞭一種可以獲得具有空間位子消息的巨额細胞轉錄組圖譜的技術法子 。

  無論是體內組織還是體外細胞系,不同細胞之間都存正在著差異性,即細胞的異質性。細胞的異質性對解釋腫瘤的發生、幹細胞或前體細胞的众能性與譜系瓦解、幹細胞與微環境的相互用意等具有主要的意義。近些年,單細胞測序技術迅疾發展,使得研讨細胞之間的異質性成為可以。不过,今朝單細胞測序的法子均會丟失細胞正在體內原有的位子消息,而對某些研正在她看來,一帶一起沿線絕大少數國度都是新興經濟體,其汽車消費是處於初級階段, 與中國車企產品的市場定位比擬吻合;同時战略利好有助於中國車企以更疾的速度、更低的本錢出口;隨著中國對外投資的增添和一帶一起根柢設備的美满 ,沿線國度對汽車凡是需求也將會增大 讨領域如發育生物學、腫瘤生物學而言,細胞來源的位子消息长短常關鍵的。陳軍正在景乃禾和彭廣敦的指導下,通過整合與優化單細胞測序和激光顯微切割技術,構修瞭一種能夠獲得巨额細胞轉錄組消息、同時保管細胞原有位子消息的測序法子:Geo-seq。

  Geo-seq是一種高效、高诀别率的空間轉錄組解析计划,既可用於轉錄圖譜的三維重修,也可以用於研讨具有额外結構的巨额組織或細胞的轉錄組消息。应用Geo-seq技術,景乃禾課題組繪制瞭小鼠晚期胚胎原腸運動中期精細的三維分子圖譜,並指导瞭小鼠細胞譜系藍圖扶植過程中的空間轉錄組特质、轉錄因子和信號通道調控網絡,相關劳动發外正在2016年的Developmental Cell雜志上 。另外,Geo-seq技術也已获胜應用於小鼠大腦發育、肝臟腫瘤學以及人的精子發育等研讨中。

  該研讨劳动是與中科院-馬普學會計算生物學夥伴研讨所韓敬東研讨組以及澳大利亞悉尼大學熏陶Patrick Tam互助竣事,失掉中科院幹細胞與再生醫學先導科技專項、國傢科技部和國傢自然科學基金委的經費撑腰。

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